O Náutico agiu rápido no mercado. Após a contratação do executivo de futebol, Edgard Montemor, o clube anunciou Marquinhos Santos como novo técnico para 2025, no último sábado (28). O treinador estava sem clube após ter rescindido com o América-RN. Pelo clube potiguar, Marquinhos Santos conquistou o Campeonato Potiguar de maneira invicta em 2024, porém foi eliminado no primeiro mata-mata da Série D, pelo Retrô.

Um dos trabalhos mais notáveis de Marquinhos Santos foi pelo Juventude, em 2019. O comandante conquistou o acesso da Série C para a Série B com o clube gaúcho, principal objetivo do Náutico para a próxima temporada. Entretanto, o trabalho não teve a continuidade esperada e Marquinhos foi demitido do clube em março do ano seguinte. Marquinhos Santos voltou a passar pelo Juventude em 2021, na Série A do Campeonato Brasileiro, porém sem sucesso.

No mesmo ano, o técnico foi contratado pelo América-MG e conseguiu mais um expressivo resultado na carreira. Pelo clube mineiro, o treinador conseguiu tirar a equipe da parte de baixo da tabela e terminou o ano na 8ª colocação da Série A, conquistando uma vaga inédita para a Libertadores da América.

Após grande momento na Série A, Marquinhos foi demitido do Coelho em 2022 e voltou a ter oportunidade na elite no mesmo ano, pela equipe do Ceará. O trabalho não entregou os resultados esperados e a demissão aconteceu com apenas dois meses no cargo do Vozão.

Entre a passagem recente pelo América-RN e trabalhos na elite, Marquinhos Santos ainda passou pelo Paysandu, na Série C, e pelo Vila Nova, na Série B, com trabalhos com menos de dois meses de duração.

O técnico de 45 anos ainda acumula passagens por grandes times do futebol brasileiro; como Coritiba, Bahia, Fortaleza, Chapecoense, Figueirense, São Bento e Londrina. Nestas passagens, Marquinhos conquistou três títulos estaduais, pelo Bahia, Coritiba e Fortaleza.

Marquinhos Santos chega para ocupar a vaga deixada por Bruno Pivette, que não renovou com o Náutico.